长期服用杞菊地黄丸可能会引起肝肾损伤、小便增多、肠胃不适等相关副作用，需要在医生指导下进行服用。
北京同仁堂杞菊地黄丸具有滋肾养肝的功效，能够用于治疗肝肾阴亏，眩晕耳鸣，羞明畏光，迎风流泪，视物昏花等症状。虽然该药物是一种中成药，副作用较小，但药物需要经过肝肾代谢，如果长期用药有可能会加重肝肾的负担，导致肝肾损伤，所以肝肾功能不全的人要慎重用药。同时，因为杞菊地黄丸的组成中有一味中药是茯苓，有一定的利水作用，所以服用杞菊地黄丸后可能会导致小便增多，但对身体健康的危害不太大。此外，有些肠胃功能比较差的人服用本品后，可能会对胃肠黏膜造成一定的刺激，出现恶心，呕吐，食欲不振等肠胃不适的反应。同时，该药物中含有一定量的菊花，有去火的作用，所以长期服用这种药物可能会导致腹泻症状。
需要注意的是，感冒发烧的病人不可以服用这种药物，患有高血压，心脏病，糖尿病，肾病等慢性病的人需要慎重用药，必须用药时一定要遵医嘱。便溏的人慎重用药，以免加重病情。
