由于口腔溃疡病因尚不明确，目前仍无根治的特效方法。治疗原则是消除病因、增强体质、对症治疗，以减少复发次数，延长间隙期，减轻疼痛，促进愈合。治疗主张全身和局部、中医和西医、生理和心理相结合。以下是近年国内外报道的西医治疗口腔溃疡的方法：
1、局部物理治疗：包括激光、低频超声、化学腐蚀(如：硝酸银)、物理屏障(如：氰基丙烯酸盐粘合剂)。
2、局部抗菌药物：氯己定含漱液、金霉素药膏。
3、局部皮质类固醇：氢化可的松或氟轻氢化泼尼松龙(triamcinolone)药膜、倍氯米松含漱液或喷雾剂等。
4、局部止痛剂：苄达明(benzydamine)含漱液或喷雾剂、局部麻醉凝胶。
5、其他局部抗炎制剂：氨来诺(amlexanox)、色甘酸钠(sodiumcromoglycate)止咳糖浆、前列腺素E2胶、局部粒细胞一巨噬细胞刺激因子、阿司匹林含漱液、双氯酚酸(diclofenac)、胃溃宁(sucraifate)。
6、全身用药：泼尼松龙(prednisolone)、咪哇硫嘌呤(azathioprine)、左旋咪唑(levamisole)、秋水仙素(colchicine)、贝通(pentoxifylline)、氨苯砜(dapsone)、甲氰咪胍(cimetidine)、转移因子等。
