化疗是临床治疗肿瘤常用的方法之一，胆囊癌也不例外。临床医生应用化疗药物治疗胆囊癌是由于化疗药物能杀死或杀伤增长较快的恶性细胞。然而，化疗药物一般都是毒性比较大的一类药物。胆囊癌化疗药物区分正常细胞与恶性细胞的能力不强，对正常细胞也有毒害，会引起明显不良反应。
有的人认为在化疗过程中，出现的化疗反应越大说明疗效越好，是这样的吗？胆囊癌化疗药物中，有些药物如氮芥、环磷酰胺、阿霉素等随着药物剂量的增加，疗效也会提高，而且还有可能在一定程度上克服恶性细胞的耐药性。当然，化疗药物的剂量加大，不良反应也就增加，从这个观点看，似乎不良反应越大，化疗效果越好有一定道理。但是，有些胆囊癌化疗药物如博莱霉素、长春新碱、平阳霉素、优福啶、哺氟啶等药物，当超出一定剂量范围后，疗效并不增加，毒性反应则明显增加。
此外，随着化疗的辅助用药的进步，药物副作用所带来的问题得以尽可能地解决，例如化疗药物引起的外周血白细胞减少，通过在应用化疗药物后加用粒细胞集落刺激因子治疗，如吉粒芬、惠尔血、格拉诺赛特等，白细胞降低的副作用并不明显，而且还能允许化疗药物的剂量增加，使疗效提高；又如大剂量顺铂化疗由于使用了枢复宁这一类止吐药物，呕吐的副作用并不强烈，而疗效比小剂量顺铂明显提高。因此，胆囊癌化疗疗效应根据具体药物，具体化疗方法，是否合并应用辅助用药等而定。单纯的说胆囊癌化疗的不良反应越大，疗效越好的说法并不完全正确。原则上应该是通过化疗获得最大疗效，并且尽可能把胆囊癌化疗药物的不良反应降至最低点。
